Chùa Phù Dung (tên trên biển hiệu: "Phù Dung cổ tự") nằm dưới chân núi Bình San, mang đậm dấu ấn Phật giáo Bắc tông. Trước sân chùa có tượng Phật Quan Thế Âm bằng xi măng trắng cao khoảng 4m; chánh điện có 5 cửa, thờ Tam Thế Phật với tượng Thích Ca Mâu Ni ở trung tâm cùng hai đại đệ tử A Nan, Ca Diếp; có 4 bức phù điêu lớn khắc bốn giai đoạn cuộc đời Đức Phật. Phía sau có lầu Ngọc Hoàng Bửu Điện thờ Ngọc Hoàng Thượng Đế, Nam Tào, Bắc Đẩu.

Tương truyền, Tổng trấn Mạc Thiên Tích đã cho dựng một am nhỏ ban đầu gọi là "Phù Cừ am tự" làm nơi tu hành cho người ái thiếp là bà Nguyễn Thị Xuân (hiệu Từ Thành Thục Nhơn, dân gian gọi "bà Dì Tự" hay "Phù Cừ"). Giai thoại dân gian và văn học (qua tiểu thuyết "Nàng Ái Cơ Trong Chậu Úp" của nữ sĩ Mộng Tuyết, xuất bản 1960) kể rằng bà từng bị chánh thất ghen ghét giam vào một chậu úp, sau được Mạc Thiên Tích giải cứu và xin xuất gia. Bên trái chùa hiện có mộ cổ của bà Nguyễn Thị Xuân, và nhà hậu tổ có thờ tượng bà cùng các vị trụ trì tiền nhiệm.

Chùa được công nhận Di tích lịch sử văn hóa cấp Tỉnh theo Quyết định số 18/2004-QĐ/UB ngày 7/4/2004 của UBND tỉnh Kiên Giang.